the theoretical study on a nano biosystem consisting of nano tube-catalytic site of bacillus subtilis α-amylase, pdb: 1ua7

نویسندگان

z. eslamifar

چکیده

α-amylase has been studied extensively from various sides. this enzyme is used in many industries .many applications of this enzyme have encouraged us for greater attempts on the study of α-amylase and to search for more effective processes. in this investigation, the structure of nanotube - catalytic site of bacillus subtilis α- amylase was optimized by hyperchem 7.0 and then it was investigated with ab initio/hartree fock and density functional theory /b3lyp methods using the sto-3g, 3-21g and 6-31g basis sets for a physicochemical explanation of interactions within these nano biosystem. then nuclear magnetic resonance (nmr) parameters and so charge, dipole moment, and stability energy were calculated on the optimized structure. we have found each of active atoms that indeed play an important role in imparting extra stability. in the current study, we have reported the nmr parameters of 8 atoms of catalytic site of bacillus subtilis alpha-amylasethe. interesting finding of the present study is that in nmr shielding for each of active atoms, o8 and o14 had maximal shift in all of levels. in catalytic mechanism of this enzyme, o14 is adopting a chair structure leading to the easy cleavage of the glucoside bond (fixer for catalysis). this investigation suggests that nanotube interactions in this nano biosystems indeed play an important role in imparting extra stability of the catalytic site of the enzyme .energy parameters in b3lyp level in different basis sets have more negative values than hf and have indicated the most stability in b3lyp6-31/g level and so dipole moment in this structure have observed that in hf3-21/g is maximum. the aim of this work was to discuss the aspects of the electronic structure of this nano biosystem to increase their advantages in practical applications.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

The Theoretical Study on a Nano Biosystem Consisting of Nano Tube-Catalytic Site of Bacillus Subtilis α-Amylase, PDB: 1UA7

α-Amylase has been studied extensively from various sides. This enzyme is used in many industries .Many applications of this enzyme have encouraged us for greater attempts on the study of α-amylase and to search for more effective processes. In this investigation, the structure of nanotube - catalytic site of bacillus subtilis α- amylase was optimized by hype...

متن کامل

the effect of consciousness raising (c-r) on the reduction of translational errors: a case study

در دوره های آموزش ترجمه استادان بیشتر سعی دارند دانشجویان را با انواع متون آشنا سازند، درحالی که کمتر به خطاهای مکرر آنان در متن ترجمه شده می پردازند. اهمیت تحقیق حاضر مبنی بر ارتکاب مکرر خطاهای ترجمانی حتی بعد از گذراندن دوره های تخصصی ترجمه از سوی دانشجویان است. هدف از آن تاکید بر خطاهای رایج میان دانشجویان مترجمی و کاهش این خطاها با افزایش آگاهی و هوشیاری دانشجویان از بروز آنها است.از آنجا ک...

15 صفحه اول

a study on the effectiveness of textual modification on the improvement of iranian upper-intermediate efl learners’ reading comprehension

این پژوهش به منظور بررسی تأثیر اصلاح متنی بر بهبود توانایی درک مطلب زبان آموزان ایرانی بالاتر از سطح میانی انجام پذیرفت .بدین منظور 115 دانشجوی مرد و زن رشته مترجمی زبان انگلیسی در این پزوهش شرکت نمودند.

a study on the effectiveness of task types (noticing-reformulation) on iranian low intermediate efl learners’ retention of collocations

چکیده پژوهش شبه تجربی حاضر به بررسی بکارگیری تمارین کلاسی که برانگیزنده آگاهی و توجه آگاهانه به همایندها بعنوان بخشی از یک دوره ی مکالمه زبان خارجی در یکی از آموزشگاه های زبان انگلیسی ایران است می پردازد.

the study of practical and theoretical foundation of credit risk and its coverage

پس از بررسی هر کدام از فاکتورهای نوع صنعت, نوع ضمانت نامه, نرخ بهره , نرخ تورم, ریسک اعتباری کشورها, کارمزد, ریکاوری, gdp, پوشش و وثیقه بر ریسک اعتباری صندوق ضمانت صادرات ایران مشخص گردید که همه فاکتورها به استثنای ریسک اعتباری کشورها و کارمزد بقیه فاکتورها رابطه معناداری با ریسک اعتباری دارند در ضمن نرخ بهره , نرخ تورم, ریکاوری, و نوع صنعت و ریسک کشورها اثر عکس روی ریسک اعتباری داردو پوشش, وثی...

15 صفحه اول

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
international journal of nanoscience and nanotechnology

ناشر: iranian nano society

ISSN 1735-7004

دوره 10

شماره 1 2014

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023